Высокочувствительный краситель ДНК/РНК APGold, 10 000х (аналог SYBR® Gold)
APGold — высокочувствительный флуоресцентный краситель для окрашивания двухцепочечной ДНК (дцДНК), одноцепочечной ДНК (оцДНК) и РНК в агарозных и полиакриламидных гелях. Является аналогом SYBR® Gold (Oxazole Gold). Предназначен для задач, требующих максимальной чувствительности детекции. Специально разработан для визуализации в видимом синем свете.
Принцип действия и спектральные характеристики
Краситель относится к классу асимметричных цианиновых красителей. При связывании с нуклеиновыми кислотами демонстрирует более чем 1000-кратное усиление флуоресценции и обладает высоким квантовым выходом (0,6–0,7).
- Максимумы возбуждения: основной — 495 нм (синий свет), гораздо менее выраженный дополнительный — 300 нм (УФ)
- Максимум эмиссии: 546 нм.
- Визуализация: для высокой чувствительности используйте синие трансиллюминаторы (SuperRay от APGENA GENOMICA, 465±20 нм). Возможна визуализация с помощью УФ трансиллюминаторов (302/312 нм), с понижением чувствительности.
Общие свойства
- Внешний вид: темно-оранжевый раствор.
- Молекулярная масса: 749.47 г/моль.
- Брутто-формула: C32H37I2N3O2
- Название (IUPAC): [2-(4-{[diethyl(methyl)ammonio]methyl}phenyl)-6-methoxy-1-methyl-4-{[(2Z)-3-methyl-1,3-benzoxazol-2-ylidene]methyl}quinolin-1-ium]
- Метод контроля качества: спектрофотометрия.
- Условия хранения: 24 месяца (с момента отгрузки) при −20°C в темноте. Транспортировка: до трех недель при комнатной температуре. Берегите от влаги.
Протокол применения (кратко)
- Приготовление рабочего раствора: 10 000× концентрированный запасной раствор в ДМСО разведите в буфере (TAE, TBE или TE с pH = 7.5-8.0) для получения 1× рабочего раствора.
- Окрашивание: полностью погрузите гель в рабочий раствор. Время инкубации составляет от 10 до 40 минут в темноте (без встряхивания).
- Визуализация: просмотрите гель на трансиллюминаторе синего света.
Продукт предлагается и продаётся исключительно в исследовательских целях. Продукт не проверяется на безопасность и эффективность в пищевых продуктах, лекарствах, медицинских приборах, косметических средствах. Нет явного или подразумеваемого разрешения на использование для любых других целей, включая, помимо прочего, диагностические цели in vitro, для людей или животных или в коммерческих целях.
Комплект поставки
- Формат: Раствор 10 000× в ДМСО.
- Упаковка: Защищенный от света флакон в картонной коробке.
- Хранение: рекомендуется хранить при −20°C в темноте.
Преимущества
- Высокочувствительная детекция: основное преимущество APGold — предельно низкий предел обнаружения, от 25 пг (9 пг) ДНК, при работе с качественными системами на основе синего света. Это делает его одним из самых чувствительных интеркалирующих красителей, превосходящим бромистый этидий (EtBr) по чувствительности в 10–50 раз.
- Исключительная чувствительность: позволяет детектировать минимальные количества нуклеиновых кислот, что критически важно для работы с малыми концентрациями образца, ПЦР-продуктами, полученными на низких циклах, профилями экспрессии и др.
- Универсальность: эффективно окрашивает все основные формы нуклеиновых кислот: дцДНК, оцДНК и РНК в нативных и денатурирующих гелях.
- Скорость и удобство: быстро проникает в гели высокой процентности. В большинстве случаев (особенно в гелях с формальдегидом) не требует процедуры отмывки благодаря низкому фону несвязанного красителя.
- Совместимость с ферментами: не ингибирует активность ключевых ферментов молекулярно-биологических исследований (Taq-ДНК-полимеразы, ДНК-лигаз, эндонуклеаз рестрикции).
- Совместимость с последующими анализами: не препятствует проведению Саузерн- и Нозерн-блоттинга. Легко удаляется из препаратов ДНК/РНК стандартным осаждением этанолом, что обеспечивает чистоту образца для дальнейших манипуляций.
