Содержание
1. Агарозный электрофорез
1.1. Введение в агарозный гель-электрофорез
1.2. Компоненты
1.3. Выбор условий электрофореза
1.4. Визуализация результатов
1.4.1. Эволюция технологии визуализации результатов электрофореза ДНК в агарозных и полиакриламидных гелях: от «загадочных невидимых лучей» — ионизирующего и ультрафиолетового излучения до безопасного синего света
1.5. Решение проблем агарозного электрофореза
- 1.5.1. Типичные проблемы при проведении агарозного гель-электрофореза, их выявление, причины возникновения и методы решения (траблшутинг)
- 1.5.2. Артефакты при электрофорезе в агарозном геле: механизмы возникновения и методы идентификации на примере анализа вариантов сплайсинга
- 1.5.3. Как модификации и последовательность ДНК влияют на прохождение агарозного гель-электрофореза
1.6. Приложения агарозного гель-электрофореза
- 1.6.1. Диагностика (траблшутинг) проблем ПЦР и qPCR методом агарозного гель-электрофореза
- 1.6.2. Препаративный и аналитический агарозный гель-электрофорез
- 1.6.3. Агарозный гель-электрофорез в пробоподготовке к NGS: оценка длины фрагментов ДНК (QC) и отбор фракций (Size Selection)
- 1.6.4. Агарозный гель-электрофорез для анализа качества геномной ДНК перед приготовлением NGS-библиотек