Содержание
1. Агарозный электрофорез
1.1. Введение в агарозный гель-электрофорез
1.2. Компоненты
1.3. Выбор условий электрофореза
1.4. Визуализация результатов
1.4.1. Эволюция технологии визуализации ДНК/РНК: от «загадочных невидимых лучей» до безопасного синего света
- 1.4.1.1. Часть 1. Ведение
- 1.4.1.2. Почему ученые выбирали изотопы и ультрафиолет: общественные тренды и методы визуализации ДНК
- 1.4.1.3. «Невидимые лучи». Эра ионизирующего излучения в визуализации результатов электрофореза ДНК (1960–1990)
- 1.4.1.4. «Невидимые лучи». Эра ультрафиолетового излучения и бромистого этидия в визуализации данных электрофореза нуклеиновых кислот (1973–2010)
- 1.4.1.5. Синий свет: новый стандарт, преодолевающий ограничения. История коммерциализации и эволюция красителей
1.5. Решение проблем агарозного электрофореза
- 1.5.1. Типичные проблемы при проведении агарозного гель-электрофореза, их выявление, причины возникновения и методы решения (траблшутинг)
- 1.5.2. Артефакты при электрофорезе в агарозном геле: механизмы возникновения и методы идентификации на примере анализа вариантов сплайсинга
- 1.5.3. Как модификации и последовательность ДНК влияют на прохождение агарозного гель-электрофореза
1.6. Приложения агарозного гель-электрофореза
- 1.6.1. Диагностика (траблшутинг) проблем ПЦР и qPCR методом агарозного гель-электрофореза
- 1.6.2. Препаративный и аналитический агарозный гель-электрофорез
- 1.6.3. Агарозный гель-электрофорез в пробоподготовке к NGS: оценка длины фрагментов ДНК (QC) и отбор фракций (Size Selection)
- 1.6.4. Агарозный гель-электрофорез для анализа качества геномной ДНК перед приготовлением NGS-библиотек